Le nom Daiquiri vient de la petite ville Daiquiri au Cuba, où le rhum-cocktail a été découvert en 1898.
Les médecins de cette ville ne savaient pas comment combattre la brusque épidémie de malaria. Le seul remède envisageable était le rhum, produit sur place. Ils espéraient que ses effets arrêteraient la fièvre. L'ingénieur américain qui travaillait dans cette entreprise de production rajouta du sucre et du jus de citron au rhum afin de le rendre plus appréciable. Ils ajoutérent également des glaçons (à partir d'eau distillée), mélangèrent le tout et se réjouirent de leur nouveau "remède" comme le font aussi les gens aujourd'hui.